Первым директором музея был лауреат Ленинской премии Л.Н. Кабаев. С 2002 по 2011 год музей возглавляла Ольга Александровна Соляр. Сейчас руководит музеем Кондратьева Татьяна Валентиновна.

Хотя музей и был создан 25 лет назад, первых посетителей он принял 15 марта 2003 года. Первая капсула на месте строительства будущего музея была заложена в 2000 году. Музей был построен на средства нефтяных компаний автономного округа. Сейчас это современный музей с богатыми фондами. Музейные коллекции включают разнообразные предметы геологии, истории геологического поиска, развития нефтяной и газовой промышленности на территории Западной Сибири.