Заведующей отделом с 1992 по 2003 год являлась Якубовская Лидия Васильевна. Под ее руководством создано более 30 фондов постоянного хранения и 20 фондов по личному составу. С 2003 по 2014 год руководила отделом Судакова Наталия Дмитриевна. Ныне руководит архивом Балковая Наталья Леонидовна. На 01.01.2022 в Пыь-Яхском городском архиве хранится 19985 ед. хр. архивных документов: 13534 ед.хр. управленческой документации, 456 ед. хр. личного происхождения, 1211 фотодокументов, 26 ед. хр. видеофонограм, 4758 ед. хр. по личному составу.