Родилась в юртах Наунак Ларьякского сельского Совета Каргасокского района Томской области в хантыйской семье. С 1939 по 1942 год Е.М. Сагандукова училась в Ханты-Мансийской фельдшерско-акушерской школе. В 1942-1944 годы работала заведующей фельдшерским пунктом в юртах Проточных Микояновского района, в 1944-1945 годах - фельдшером участковой больницы в с. Полноват Микояновского района. С сентября 1945 года училась в медицинском институте в г. Омске. По окончании института в августе 1950 года занимала должность врача-педиатра в Ханты-Мансийской окружной больнице. С января 1951 по март 1953 года работала врачом ординатором хирургического отделения окружной больницы. В марте 1953 года заняла пост заведующей окрздравотделом Ханты-Мансийского окрисколкома. С октября 1963 по 21 марта 1965 года выполняла обязанности заместителя председателя исполнительного комитета Совета депутатов трудящихся Ханты-Мансийского национального округа. С марта 1965 по март 1969 года Е.М. Сагандукова - главный врач Ханты-Мансийского окружного детского туберкулезного санатория. В марте 1969 года утверждена заведующей окружным отделом здравоохранения. Позднее вновь работала в детском туберкулезном санатории.
Избиралась депутатом Верховного Совета СССР пятого созыва, неоднократно - депутатом окружного и Тюменского областного Совета депутатов трудящихся. Награждена медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне», орденом «Знак Почета», медалью «30 лет Победы в Великой Отечественной войне», медалью «За доблестный труд в ознаменование 100-летия со дня рождения В.И. Ленина», медалью «Ветеран труда, отраслевым значком «Отличник здравоохранения». 12 декабря 1980 года Указом Президиума Верховного Совета РСФСР Е.М. Сагандуковой присвоено почетное звание «Заслуженный врач РСФСР». Ее имя было занесено на Окружную Доску почета в честь 60-летия образования СССР. Награждалась почетными грамотами облисполкома, окрисполкома, облздравотдела и окружного отдела здравоохранения. В г. Ханты-Мансийске КУ Ханты-Мансийского автономного округа - Югры «Детский противотуберкулерзный санаторий» присвоено имя Е.М. Сагандуковой.
В Государственном архиве Югры хранятся документы Е.М. Сагандуковой, среди них: доклады об итогах работы сессий Верховного Совета СССР, статьи из газет и журналов о Е.М. Сагандуковой, переписка с избирателями, фотографии.
