Родился в п. Варьеган Сургутского (ныне Нижневартовского) района Ханты-Мансийского национального (ныне автономного) округа в семье потомственного охотника-ханты. В 1967 году, после окончания восьмилетней школы, работал в Варьеганском промыслово-охотничьем хозяйстве. В 1971 году окончил Ханты-Мансийское педагогическое училище, в 1976 году — Литературный институт имени Горького. Служил в рядах Советской Армии. Работал помощником бурильщика и плотником на строительстве железной дороги Тюмень — Сургут — Нижневартовск. С 1976 по 1978 год работал корреспондентом Ханты-Мансийского окружного комитета по телевидению и радиовещанию. С 1978 года Е.Д. Айпин — редактор окружного научно-методического центра народного творчества в Ханты-Мансийске.
Литературной деятельностью занимается с 1969 года. С 1972 года печатается в журналах. В 1979 году в Свердловске издается первый сборник повестей «В ожидании первого снега». В 1981 году выходит новая книга «В тени старого кедра» на русском и хантыйском языках. Рассказы переведены на испанский и венгерский языки. В 1981 году Е.Д. Айпин становится членом Союза писателей СССР.
Еремей Данилович Айпин – известный общественный деятель. Депутат Думы Ханты-Мансийского автономного округа – Югры, заместитель Председателя Думы - председатель Ассамблеи представителей коренных малочисленных народов Севера.
Имеет награды: медали ордена «За заслуги перед Отечеством» I и II степени, знак Министерства культуры СССР «За отличную работу»; знак «За заслуги перед Ханты-Мансийский автономным округом», знак Ханты-Мансийского автономного округа – Югры «За вклад в развитие законодательства», звание «Заслуженный деятель культуры Ханты-Мансийского автономного округа», лауреат премии Губернатора Ханты-Мансийского автономного округа в области литературы, лауреат Международной литературной премии «Югра», лауреат Всероссийской литературной премии им. Д.Н. Мамина-Сибиряка, благодарности и почетные грамоты.